plotpipe: Updated to support >3 columns, titles, and headers.
This commit is contained in:
parent
bb5f8e269a
commit
30f10bbdf1
6
plotpipe/example1.csv
Normal file
6
plotpipe/example1.csv
Normal file
|
@ -0,0 +1,6 @@
|
||||||
|
Header1,header2,header3
|
||||||
|
1,2,3
|
||||||
|
2,4,5
|
||||||
|
3,4,7
|
||||||
|
4,2,1
|
||||||
|
5,1,2
|
|
6
plotpipe/example2.csv
Normal file
6
plotpipe/example2.csv
Normal file
|
@ -0,0 +1,6 @@
|
||||||
|
Header1;header2;header3
|
||||||
|
1;2;3
|
||||||
|
2;4;5
|
||||||
|
3;4;7
|
||||||
|
4;2;1
|
||||||
|
5;1;2
|
|
9
plotpipe/example3.csv
Normal file
9
plotpipe/example3.csv
Normal file
|
@ -0,0 +1,9 @@
|
||||||
|
#Title line1 with "
|
||||||
|
#Title line2 with '
|
||||||
|
Header1 header 2 header3
|
||||||
|
1 2 3
|
||||||
|
2 100 0
|
||||||
|
3 4 7
|
||||||
|
5 1
|
||||||
|
6 1
|
||||||
|
6 4 4
|
Can't render this file because it contains an unexpected character in line 1 and column 19.
|
6
plotpipe/example4.csv
Normal file
6
plotpipe/example4.csv
Normal file
|
@ -0,0 +1,6 @@
|
||||||
|
Header1 header2 header3
|
||||||
|
1 2 3
|
||||||
|
2 4 5
|
||||||
|
3 4 7
|
||||||
|
4 2 1
|
||||||
|
5 1 2
|
|
6
plotpipe/example5.csv
Normal file
6
plotpipe/example5.csv
Normal file
|
@ -0,0 +1,6 @@
|
||||||
|
Header1 header2 header3
|
||||||
|
1 4 3
|
||||||
|
2 4 5
|
||||||
|
3 4 7
|
||||||
|
4 2 1
|
||||||
|
5 1 2
|
|
|
@ -4,7 +4,7 @@
|
||||||
|
|
||||||
=head1 NAME
|
=head1 NAME
|
||||||
|
|
||||||
plotpipe - Plot 1D-data or 2D-data from a pipe
|
plotpipe - Plot CSV data from a pipe
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
=head1 SYNOPSIS
|
=head1 SYNOPSIS
|
||||||
|
@ -16,6 +16,9 @@ I<datagenerator> | B<plotpipe> [-H] [-0] [-C str] [-h] [-V]
|
||||||
|
|
||||||
B<plotpipe> is a simple wrapper for GNUPlot to simply plot 1D and 2D-data.
|
B<plotpipe> is a simple wrapper for GNUPlot to simply plot 1D and 2D-data.
|
||||||
|
|
||||||
|
The input is a CSV-file. Lines starting with '#' will be used as
|
||||||
|
titles on the plot.
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
=head1 OPTIONS
|
=head1 OPTIONS
|
||||||
|
|
||||||
|
@ -25,14 +28,17 @@ B<plotpipe> is a simple wrapper for GNUPlot to simply plot 1D and 2D-data.
|
||||||
|
|
||||||
=item B<-C> I<string>
|
=item B<-C> I<string>
|
||||||
|
|
||||||
Use I<string> as column separator.
|
Use I<string> as column separator. B<plotpipe> will try to autoguess
|
||||||
|
the separator. If it guesses wrong, use B<--colsep>.
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
=item B<--header>
|
=item B<--header>
|
||||||
|
|
||||||
=item B<-H>
|
=item B<-H>
|
||||||
|
|
||||||
Ignore first line of input (it is a header).
|
Use the first line as legend for data in columns. B<plotpipe> will try
|
||||||
|
to autoguess if the first line is a header. If it guesses wrong, use
|
||||||
|
B<--header>.
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
=item B<--help>
|
=item B<--help>
|
||||||
|
@ -65,10 +71,40 @@ Plot the points (1,101) .. (100,200):
|
||||||
|
|
||||||
paste <(seq 100) <(seq 101 200) | plotpipe
|
paste <(seq 100) <(seq 101 200) | plotpipe
|
||||||
|
|
||||||
|
Plot the points (1,101) .. (100,200) and (1,300) .. (100,102):
|
||||||
|
|
||||||
|
paste <(seq 100) <(seq 101 200) <(seq 300 -2 102) | plotpipe
|
||||||
|
|
||||||
|
=head1 EXAMPLE
|
||||||
|
|
||||||
|
input.csv:
|
||||||
|
|
||||||
|
#Title line 1
|
||||||
|
#This is title line 2
|
||||||
|
X-axis-header Values1 Values2
|
||||||
|
1 28 32
|
||||||
|
2 12 35
|
||||||
|
3 3.5 3.5
|
||||||
|
|
||||||
|
cat input.csv | plotpipe
|
||||||
|
|
||||||
|
=head1 EXAMPLE
|
||||||
|
|
||||||
|
input.csv:
|
||||||
|
|
||||||
|
#Title line 1
|
||||||
|
#This is title line 2
|
||||||
|
X axis header,Values 1,Values 2
|
||||||
|
1,28,32
|
||||||
|
2,12,35
|
||||||
|
3,3.5,3.5
|
||||||
|
|
||||||
|
cat input.csv | plotpipe
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
=head1 AUTHOR
|
=head1 AUTHOR
|
||||||
|
|
||||||
Copyright (C) 2019 Ole Tange,
|
Copyright (C) 2019-2020 Ole Tange,
|
||||||
http://ole.tange.dk and Free Software Foundation, Inc.
|
http://ole.tange.dk and Free Software Foundation, Inc.
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
@ -150,25 +186,168 @@ sub help() {
|
||||||
"",);
|
"",);
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
sub shell_quote_scalar_default($) {
|
||||||
|
# Quote for other shells (Bourne compatibles)
|
||||||
|
# Inputs:
|
||||||
|
# $string = string to be quoted
|
||||||
|
# Returns:
|
||||||
|
# $shell_quoted = string quoted as needed by the shell
|
||||||
|
my $s = $_[0];
|
||||||
|
if($s =~ /[^-_.+a-z0-9\/]/i) {
|
||||||
|
$s =~ s/'/'"'"'/g; # "-quote single quotes
|
||||||
|
$s = "'$s'"; # '-quote entire string
|
||||||
|
$s =~ s/^''//; # Remove unneeded '' at ends
|
||||||
|
$s =~ s/''$//; # (faster than s/^''|''$//g)
|
||||||
|
return $s;
|
||||||
|
} elsif ($s eq "") {
|
||||||
|
return "''";
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
# No quoting needed
|
||||||
|
return $s;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
sub Q($) {
|
||||||
|
return shell_quote_scalar_default($_[0]);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
sub my_dump(@) {
|
||||||
|
# Returns:
|
||||||
|
# ascii expression of object if Data::Dump(er) is installed
|
||||||
|
# error code otherwise
|
||||||
|
my @dump_this = (@_);
|
||||||
|
eval "use Data::Dump qw(dump);";
|
||||||
|
if ($@) {
|
||||||
|
# Data::Dump not installed
|
||||||
|
eval "use Data::Dumper;";
|
||||||
|
if ($@) {
|
||||||
|
my $err = "Neither Data::Dump nor Data::Dumper is installed\n".
|
||||||
|
"Not dumping output\n";
|
||||||
|
::status($err);
|
||||||
|
return $err;
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
return Dumper(@dump_this);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
# Create a dummy Data::Dump:dump as Hans Schou sometimes has
|
||||||
|
# it undefined
|
||||||
|
eval "sub Data::Dump:dump {}";
|
||||||
|
eval "use Data::Dump qw(dump);";
|
||||||
|
return (Data::Dump::dump(@dump_this));
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
sub max(@) {
|
||||||
|
# Returns:
|
||||||
|
# Maximum value of array
|
||||||
|
my $max;
|
||||||
|
for (@_) {
|
||||||
|
# Skip undefs
|
||||||
|
defined $_ or next;
|
||||||
|
defined $max or do { $max = $_; next; }; # Set $_ to the first non-undef
|
||||||
|
$max = ($max > $_) ? $max : $_;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
return $max;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
sub find_sep(@) {
|
||||||
|
# Try common find the separators.
|
||||||
|
# Do we get the same for each line?
|
||||||
|
my @csv = grep { not /^#/ } @_;
|
||||||
|
my @sep = (",", "\t", ";", '\s+');
|
||||||
|
my $columns;
|
||||||
|
my %col;
|
||||||
|
for my $sep (@sep) {
|
||||||
|
for my $line (@csv) {
|
||||||
|
$columns = split /$sep/, $line;
|
||||||
|
if($columns > 1) {
|
||||||
|
$col{$sep."\0".$columns}++
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
# Find max $col{$sep,$columns}
|
||||||
|
my $most_lines = max(values %col);
|
||||||
|
|
||||||
|
my %sepcol = (map { split /\0/, $_ }
|
||||||
|
grep { $col{$_} == $most_lines } keys %col);
|
||||||
|
my $most_cols = max(values %sepcol);
|
||||||
|
return ((grep { $sepcol{$_} == $most_cols } keys %sepcol)[0]);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
Getopt::Long::Configure("bundling","require_order");
|
Getopt::Long::Configure("bundling","require_order");
|
||||||
my $retval = GetOptions(options_hash());
|
my $retval = GetOptions(options_hash());
|
||||||
$Global::progname = "plotpipe";
|
$Global::progname = "plotpipe";
|
||||||
$Global::version = 20200810;
|
$Global::version = 20201005;
|
||||||
if($opt::version) { version(); exit 0; }
|
if($opt::version) { version(); exit 0; }
|
||||||
if($opt::help) { help(); exit 0; }
|
if($opt::help) { help(); exit 0; }
|
||||||
if($opt::null) { $/ = "\0"; }
|
if($opt::null) { $/ = "\0"; }
|
||||||
$opt::colsep ||= '\s+';
|
|
||||||
if($opt::header) { <> }
|
# Read csv
|
||||||
$line1 = <>;
|
my @csv = <>;
|
||||||
@col = split /$opt::colsep/, $line1;
|
|
||||||
if($#col == 1) {
|
# Title = lines starting with #
|
||||||
# 2 col
|
my @title = map { s/^#//; s/"/''/g; $_ } map { "$_" } grep { /^#/ } @csv;
|
||||||
open GNUPLOT,"|-", q(gnuplot -p -e 'plot "/dev/stdin"') or die;
|
if(@title) { chomp($title[$#title]); }
|
||||||
} elsif($#col == 2) {
|
@csv = grep { not /^#/ } @csv;
|
||||||
# 3 col (3rd = color)
|
|
||||||
open GNUPLOT,"|-", q(gnuplot -p -e 'plot "/dev/stdin" using 1:2:3 with points palette') or die;
|
# Autoguess separator
|
||||||
} else {
|
if(not defined $opt::colsep) {
|
||||||
die "$#col,@col,$line1";
|
$opt::colsep = find_sep(@csv);
|
||||||
}
|
}
|
||||||
print GNUPLOT $line1, <>;
|
|
||||||
|
# Autoguess header
|
||||||
|
my @header;
|
||||||
|
if(not defined $opt::header) {
|
||||||
|
# Autodetect header
|
||||||
|
# if line 1 contains a-z => header
|
||||||
|
@header = split /$opt::colsep/, $csv[0];
|
||||||
|
for(@header) {
|
||||||
|
if(/[a-z]/i) { $opt::header = 1; last; }
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
if($opt::header) {
|
||||||
|
@header = split /$opt::colsep/, $csv[0];
|
||||||
|
chomp(@header);
|
||||||
|
shift @csv;
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
@header = ();
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
# Save data to tmpfile that will be read by Gnuplot
|
||||||
|
use File::Temp qw(tempfile);
|
||||||
|
$ENV{'TMPDIR'} ||= "/tmp";
|
||||||
|
my($filehandle,$filename) =
|
||||||
|
tempfile(DIR=>$ENV{'TMPDIR'}, TEMPLATE => 'plotXXXXX');
|
||||||
|
for(@csv) {
|
||||||
|
chomp;
|
||||||
|
# print((join "\t", split /$opt::colsep/, $_),"\n");
|
||||||
|
print $filehandle ((join "\001", split /$opt::colsep/, $_),"\n");
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
# Generate the variant part of Gnuplot script
|
||||||
|
my $ncols = split /$opt::colsep/, $csv[0];
|
||||||
|
for(my $col = 2; $col <= $ncols; $col++) {
|
||||||
|
my $legend;
|
||||||
|
if($opt::header) {
|
||||||
|
$legend = qq( title "$header[$col-1]");
|
||||||
|
}
|
||||||
|
push @plotscript, qq("$filename" using 1:$col with lines $legend,);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
# Make full Gnuplot script
|
||||||
|
my $plotscript=<<_EOS ;
|
||||||
|
set title "@title";
|
||||||
|
set xtics rotate;
|
||||||
|
set autoscale;
|
||||||
|
set xlabel "$header[0]";
|
||||||
|
set grid;
|
||||||
|
set key right center;
|
||||||
|
set datafile separator "\001";
|
||||||
|
plot @plotscript
|
||||||
|
_EOS
|
||||||
|
|
||||||
|
open GNUPLOT,"|-", "gnuplot -p -e ".Q($plotscript) or die;
|
||||||
|
# print "gnuplot -p -e ".($plotscript);
|
||||||
close GNUPLOT;
|
close GNUPLOT;
|
||||||
|
unlink $filename;
|
||||||
|
|
Loading…
Reference in a new issue